Quá trình trưởng thành và phát triển của trường THPT Tự Lập, Công đoàn trường đóng một vai trò không thể thiếu. Công đoàn vừa là nơi chăm lo đời sống vật chất, vừa là chỗ dựa, là nơi sẻ chia những tâm tư, nguyện vọng với người lao động trong nhà trường, tạo niềm tin tưởng và động lực để họ tích cực cống hiến.
Công đoàn trường THPT Tự Lập ra đời năm 2006 cùng với sự thành lập của nhà trường. Những ngày đầu thành lập, trường có 9 công đoàn viên. Sau chặng đường 17 năm, tổ chức công đoàn nhà trường đã có 59 công đoàn viên, với 4 tổ công đoàn.
Nhiệm kì 2023 – 2028, Công đoàn trường THPT Tự Lập đã kiện toàn BCH Công đoàn gồm 5 đồng chí: Đ/c Hoàng Thanh Giang- Chủ tịch công đoàn, Đ/c Mầu Thu Lương - Phó chủ tịch, Đ/c Phạm Văn Minh- Ủy viên, Đ/c Bùi Toàn Quốc- Ủy viên, Đ/c Trần Thị Thắng - Ủy viên.